El Consejo Superior Universitario es el máximo organismo de dirección y gobierno de la Universidad Francisco de Paula Santander. Sus principales funciones son definir y aprobar políticas académicas y administrativas, además de la planeación institucional.

Integrantes

• William Villamizar Laguado, Gobernador del Departamento - Presidente del Consejo Superior Universitario
• Armando Enrique Monsalve Vasquez, Representante Presidente de la República
• Maria Fernanda Polanía Correa, Delegada Ministra de Educación
• Claudia Elizabeth Toloza Martínez, Rectora UFPS
• Edgar Antonio Sánchez Ortíz, Director UFPS – Seccional Ocaña
• Pedro Ontiveros Gil, Representante de los Ex – rectores
• Henry de Jesús Gallardo Pérez, Representante Profesoral
• Maribel Cárdenas García, Representante Profesoral – 2a. línea
• Germán Darío Garrido Olave, Representante Estudiantil
• Jaime Eduardo Díaz García, Representante Estudiantil – 2a. línea
• Ruby Elizabeth Vargas Toloza, Representante de las Directivas Académicas
• Amilcar José Mirep Corona, Representante Sector Productivo 
• Adriana Rodríguez Lizcano, Secretaria General